Торжества по случаю Дня Военно-морского Флота в Севастополе начались с праздничного богослужения. Благодарственный молебен святым покровителям и заступникам российского воинства в Храме Архистратига Божия Михаила отслужил Митрополит Симферопольский и Крымский Лазарь. Под церковными сводами вознесли молитву представители духовенства и военнослужащие. Присутствовал и командующий Черноморским флотом Александр Моисеев.
Во время обороны Севастополя Михайловская церковь заменяла собою Севастопольский Адмиралтейский собор. В этой церкви в продолжение всей осады Севастополя непрерывно совершались богослужения, здесь же были отпеты погребения славных защитников Севастополя – адмиралов Корнилова, Истомина и Нахимова. После 1920 года богослужение в церкви было прекращено, с 1968 года в здании находился зал музея Черноморского флота, где был представлен послевоенный период флота. В 2002 году в храме впервые после 80-летнего забвения была отслужена Божественная литургия. В 2012 году новый Министр обороны Российской Федерации Сергей Шойгу принял решение о реставрации воинского храма на средства военного ведомства России.